2016年，为加强西部地区疾控体系能力建设，提升西部地区各省（自治区、直辖市）疾控机构传染病监测、暴发调查处置和重点传染病干预的技术能力，满足西部地区人才培养的需要，经国家卫生健康委批准立项，中国疾控中心依托CFETP，设立西部地区现场流行病学培训专项（简称西部地区FETP），专门针对西部地区省级和地市级疾控机构培训应用型流行病学骨干人员，为西部地区“健康中国”建设和国家“一带一路”倡议的顺利实施发挥卫生保障作用。2020年4月份以来，东北三省相继发生新冠肺炎聚集性疫情，应对过程中凸显出现场流行病学人员缺乏的问题，为了进一步提升当地现场流行病学调查能力，招生扩展至东北三省，并将西部地区FETP改名为“中级现场流行病学培训项目”（中级FETP），继续以西部省份为招生培养重点，有计划向部分中部等省份拓展招生培养。

中级FETP每年招收1期，每期40人。采用“干中学”培训模式和国际推荐的9个月中级培训项目周期，在教师全程指导和管理下，学员通过理论知识的强化学习和疾病监测、暴发调查及专题调查（如干预措施快速评估）等工作实践，以显著提高和强化学员以应用流行病学为核心的职业胜任力。同时，塑造和强化学员的“敬业、团队、探索、求实”的职业精神。2016-2021年，中级FETP共招收了内蒙古、辽宁、吉林、黑龙江、广西、四川、重庆、贵州、云南、西藏、陕西、甘肃、宁夏、新疆、青海和海南等16个省份疾控中心的6期239名学员。其中181人已顺利毕业，在各自省份的公共卫生一线工作岗位发挥着尖刀兵的作用，多数已成为国家和地方传染病应急处置的业务骨干和科室带头人。

中级FETP为我国疾控队伍培养了大量的骨干人才，在一定程度上缓解了我国特别是西部地区公共卫生人才紧缺的局面。在新冠疫情应对中，中级FETP毕业生和在训学员们积极参加各省市的防控应对工作，每一个重要疫情现场都有中级FETP毕业生的身影出现，并有多名毕业生得到国家、省和市级的表彰，为我国疫情防控做出了重要的贡献。